魅族16支持指纹支付，魅族16不仅支持屏下指纹识别技术，还支持面部识别技术。不过魅族16不支持面部支付，仅支持指纹支付，根据李楠介绍，魅族16解锁仅需0.25s。魅族16的屏下指纹识别率可达99.12%，在体验效果上甚至比实体指纹识别更好。
目前屏下指纹识别方案有两种，一种是以Synaptics以及汇顶科技为代表的光学屏下指纹技术，另一种则是以高通为代表的超声波屏下指纹技术，目前已经商用了光学屏下指纹技术，而超声波屏下指纹至今还未商用。从实际使用体验来看，光学屏下指纹不仅在解锁时需要屏幕开启最高亮度以照亮指纹，而且在识别精准度以及安全性方面都有待提升。
魅族16的屏下指纹识别可以更安全的保护手机与隐私，还能提升全面屏的体验。由于全面屏占用了指纹识别的区域，因此目前全面屏的指纹识别多位于机身背部，影响指纹识别的使用体验，而屏下指纹的识别区域位于屏幕中，因此不会受到全面屏的影响，也是未来全面屏手机的发展方向。
