主要区别如下：1、企业门槛不同创新层、精选层对挂牌企业的要求不同，精选层的门槛是最高的。另外，监督部门对精选层企业的信息披露要求、监督管理也是更严格的。2、交易机制不同创新层采用的是集合竞价交易方式，每10分钟撮合一次，而精选层采用连续竞价的方式进行交易。3、投资者门槛不同创新层、精选层对投资者的资金要求不同，创新层是150元，而精选层是100万元。
