阿姆河源于帕米尔高原东南部海拔4900米的高山冰川，它是中亚水量最大的内陆河，咸海的两大水源之一。上源瓦赫基尔河位于阿富汗境内，自东向西流，汇合帕米尔河后，成为阿富汗与塔吉克斯坦界河，并改称瓦汉河。此后，先北折再南回，继续西流，自转弯处起称作喷赤河。从右岸接纳了来自塔吉克斯坦的瓦赫什河后，才始称阿姆河。
沿阿、塔两国边境继续西流，又依次经过阿富汗与乌兹别克斯坦、阿富汗与土库曼斯坦两国边境，转向西北入土库曼斯坦境内图兰低地，沿克孜勒库姆沙漠和卡拉库姆沙漠之间的乌、土两国交界地带蜿蜒穿行，于乌兹别克斯坦的木伊纳克附近入咸海。习惯上把瓦赫什(Vakhsh)河和喷赤(Pyandzh)河汇合处作为它的起点，到咸海南岸出海长1,415公里(879哩)，若从东帕米尔的河源起算，全长2,540公里(1,578哩)。
