免税店免的是关税、增值税和消费税。关税是引进出口商品经过一国关境时，由政府所设置的海关向其引进出口商所征收的税收。免税店是免了进口增值税和关税，是在进口时候免了关税和增值税，但是不会免销售时的增值税，消费税是在对货物普遍征收增值税的基础上，对少数消费品再征收的一个税种。
计算进口增值税计算公式:进口增值税=（关税完税价格+关税）/（1-消费税率）×增值税率。进口关税税款的基本公式是：进口关税税额=完税价格×进口关税税率。
我国现行消费税的征收范围主要包括：烟、酒、贵重首饰、高档化妆品、成品油、小汽车、高档手表等等。对于内地而言，化妆品和烟酒的税率是很高的，所以免税店里的化妆品、烟酒的价格就比外面便宜了很多。
免税商品所免征的税种包括关税、进口环节的增值税、消费税等，并非免去所有环节的所有税种的税。说它免税，仅仅针对进口环节而言，当其进入销售环节时，还应照章征税。因此，免税商店零售免税货物时应缴纳增值税。
